Τα εκθέματα του Μουσείου είναι οργανωμένα και τοποθετημένα σε 10 ενότητες
- Αρχείο της ιδρύτριας Ειρήνης Καλλιγά.
- Αρχείο σε ντοσιέ και θυρίδες μελών (Μελών Δ.Σ., Εφόρων Κλάδων, Εκπαιδευτών, Κατασκηνωτών και διαφόρων απλών μελών).
- Ιστορικό αρχείο ΣΕΟ, αρχείο κλάδων, αρχείο Τοπικών Τμημάτων, Ειδικών Ομάδων, Αστικών Κέντρων , φωτογραφικό αρχείο.
- Δραστηριότητες Ομάδων, στελεχών, οδηγών, Τοπικών Τμημάτων, Ομάδων Συνεργασίας.
- Αρχείο εκδόσεων από το 1932 και εντεύθεν (εκδόσεις ΣΕΟ, περιοδικό η Οδηγός, τουι-του, τα Πουλιά , γοργοχελίδονο, Δελτίο Εφόρων και Αρχηγών, Μηνύματα, Νέα μηνύματα, Παρέα).
- Στολές από το 1932.
- Σημαίες, διακρίσεις, σήματα, διακριτικά, συλλογές σημάτων, αναμνηστικά σημαντικών εκδηλώσεων.
- Αφίσσες.
- Κατασκηνωτική γωνιά.
- Οδηγική Γωνιά /Ενωμοτία.
Από τα σημαντικά και μοναδικά εκθέματα που εκτίθενται στο Μουσείο αναφέρουμε ενδεικτικά τα εξής:
- Ένα πολύ παλιό χάρτη από τα Γραφεία της οδού Επτανήσου με όλα τα Τοπικά Τμήματα και Τοπικές Ομάδες που υπήρξε και υπάρχει οδηγισμός.
- Την πρώτη Οδηγική Σημαία που είχε χαθεί μετά την αυτοδιάλυση του ΣΕΟ το 1939 επί Μεταξά, η οποία βρέθηκε σε ένα παλαιοπωλείο στο Μοναστηράκι.
- Πλούσιο υλικό από το ΣΕΟ Λυών Γαλλίας, δωρεάς κας Κατερίνας Τσαγκαράκη.